46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4349 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  47.06 
 
 
294 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  47.5 
 
 
273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  40.4 
 
 
296 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  43.35 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  44.83 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  41.76 
 
 
272 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  43.45 
 
 
271 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  40.98 
 
 
303 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  38.34 
 
 
274 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  41.46 
 
 
289 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  40.48 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  38.82 
 
 
275 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  35.39 
 
 
324 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  37.71 
 
 
284 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  38.29 
 
 
284 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  37.63 
 
 
262 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  36.42 
 
 
309 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  37.5 
 
 
285 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  34.86 
 
 
270 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  34.5 
 
 
320 aa  92  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  34.52 
 
 
320 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  34.3 
 
 
267 aa  91.3  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  35.71 
 
 
300 aa  90.9  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
292 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  31.4 
 
 
313 aa  84.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  35.52 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  35.63 
 
 
277 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  28.74 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  33.85 
 
 
279 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  30.73 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  32.7 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  25.27 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  30 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  28.74 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  32.43 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  26.51 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  26.19 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  31.54 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  29.6 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  32.48 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  33 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  38.67 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  31.61 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  26.44 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  25.17 
 
 
199 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>