49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1948 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
192 aa  396  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  60.75 
 
 
188 aa  231  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  46.33 
 
 
180 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  44.57 
 
 
181 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  44.81 
 
 
217 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  43.65 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  42.05 
 
 
180 aa  124  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  37.71 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  38.73 
 
 
217 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  38.2 
 
 
214 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  35.29 
 
 
216 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  32.95 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  32.79 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  39.34 
 
 
220 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  37.57 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  33.79 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  37.04 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  35.98 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  34.73 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  38.3 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  38.13 
 
 
278 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  34.03 
 
 
307 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  37.06 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  35.21 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  34.51 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  34.46 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  37.84 
 
 
271 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  35.47 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  35.42 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  35.66 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  35.92 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  34.27 
 
 
284 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  37.3 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  38.26 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  31.58 
 
 
272 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  36.36 
 
 
261 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  36.63 
 
 
313 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  34.65 
 
 
292 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  32.72 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  32.67 
 
 
270 aa  57.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  31.79 
 
 
277 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  32.37 
 
 
267 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
267 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  32.48 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  37.5 
 
 
274 aa  44.7  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  51.22 
 
 
262 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  26.9 
 
 
289 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  36.94 
 
 
296 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>