37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  48.17 
 
 
289 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  46.69 
 
 
294 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  40 
 
 
265 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  34.71 
 
 
274 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  34.25 
 
 
271 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  38.85 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  35.38 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  33.91 
 
 
296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  33.22 
 
 
275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  33.93 
 
 
272 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  35.89 
 
 
273 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  40.98 
 
 
198 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  34.6 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  34.05 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  34.77 
 
 
285 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  33.69 
 
 
284 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  32.87 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  28.52 
 
 
270 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  30.34 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  31.27 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  30.11 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  27.97 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  25.57 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  28.37 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  27.92 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  26.28 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  27.09 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  26.76 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  27 
 
 
320 aa  59.3  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  26.8 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  27.87 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  29.19 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  31.67 
 
 
205 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  31.93 
 
 
180 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  32.91 
 
 
216 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  28.21 
 
 
220 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>