51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2001 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  97.5 
 
 
320 aa  639    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  654    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  64.21 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  55.35 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  43.12 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  37.82 
 
 
313 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  33.76 
 
 
307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  36.88 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  40.07 
 
 
270 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  33.43 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  36.06 
 
 
284 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  35.69 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  34.94 
 
 
285 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  36.9 
 
 
261 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  36.63 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  31.65 
 
 
272 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  32.96 
 
 
265 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  35.61 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  31.47 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  29.58 
 
 
270 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  34.83 
 
 
267 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  31.14 
 
 
275 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  32.16 
 
 
278 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  33.71 
 
 
262 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  31.09 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  33.14 
 
 
180 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  35.42 
 
 
207 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  34.52 
 
 
198 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  33.11 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  27.92 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  32.96 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  32.94 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  33.56 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  35.21 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  32.87 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  36.02 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  31.25 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  52.05 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  28.74 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  29.89 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  45.83 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  25.86 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  35.21 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  30.07 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  29.94 
 
 
209 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  31.65 
 
 
220 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  27 
 
 
303 aa  59.3  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  32.9 
 
 
215 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  30.25 
 
 
220 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  30.99 
 
 
214 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>