47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2308 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  45.9 
 
 
267 aa  191  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  34.15 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  36.5 
 
 
277 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  32.38 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  32.48 
 
 
275 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  32.71 
 
 
261 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  33.21 
 
 
278 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  31.6 
 
 
272 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  32.32 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  31.43 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  32.95 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  32.23 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  34.3 
 
 
198 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  31.87 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  27.97 
 
 
292 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  30.88 
 
 
324 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  29.52 
 
 
294 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  30.5 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  28.2 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  30.36 
 
 
296 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  32.96 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  33.46 
 
 
262 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  28.72 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  29.03 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  33.84 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  28.15 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  36.42 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  32.59 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  27.11 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  29.63 
 
 
217 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  27.24 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  34.64 
 
 
181 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  35.42 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  30.26 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  32.95 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  27.12 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  34.21 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  29.73 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  38.39 
 
 
201 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  34.46 
 
 
188 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  28.48 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  29.45 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  33.66 
 
 
199 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  27.81 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  33.33 
 
 
192 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  27.74 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>