50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4150 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 
271 aa  534  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  40.75 
 
 
261 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  48.81 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  39.27 
 
 
275 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  41.04 
 
 
265 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  39.16 
 
 
272 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  41.7 
 
 
284 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  41.7 
 
 
285 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  40.93 
 
 
284 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  39.61 
 
 
278 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34690  hypothetical protein  34.25 
 
 
303 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  35.44 
 
 
324 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  36.9 
 
 
300 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  36.63 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  37.27 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3099  protein of unknown function DUF1684  36.19 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  36.63 
 
 
320 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  32.49 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  34.8 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  33.83 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  43.53 
 
 
198 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  38.2 
 
 
279 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  41.54 
 
 
289 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  37.92 
 
 
277 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  30.96 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  30.66 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  32.58 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  32.34 
 
 
309 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  32.19 
 
 
313 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  30.8 
 
 
307 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  33.84 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  32.33 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  38.51 
 
 
214 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  37.67 
 
 
217 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  38.78 
 
 
181 aa  89.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  37.93 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  33.99 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  39.04 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  37.84 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  32.64 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  34.01 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  31.54 
 
 
207 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  29.21 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  26.8 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  33.77 
 
 
220 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  35.29 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  34.44 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  29.7 
 
 
199 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  28.29 
 
 
215 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>