42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  70 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  56.93 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  56.44 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  63.29 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  56.22 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  35.71 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  34.78 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  36.72 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  35.03 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  38.92 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  32.46 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  37.36 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  27.37 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  33.8 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  33.93 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  32.34 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  36.13 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  34.21 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  34.19 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  34.19 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  25.71 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  30.91 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  33.78 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  38.55 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  32.89 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  33.55 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  32.95 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  32.43 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  29.66 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  30.38 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  31.58 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  28.48 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  32.03 
 
 		 270 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  32.21 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  35.29 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  36.56 
 
 		 275 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  33.96 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  28.57 
 
 		 277 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  34.65 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  44.68 
 
 		 262 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>