More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2143 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 503 aa  1040    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2805  carbohydrate kinase FGGY  63.8 
 
 		 493 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  44.35 
 
 		 498 aa  438  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  44.02 
 
 		 497 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  45.12 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  43 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  43.35 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  42.74 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  41.34 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  44.56 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  41.34 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  42.94 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  41.14 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  41.14 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  41.34 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  41.14 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  41.14 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  43.06 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  41.68 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  41.68 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  41.28 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  41.68 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  41.68 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2059  glycerol kinase  42.28 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000191654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  41.68 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  42.51 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  41.7 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  40.53 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  40.73 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  42.63 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  43.06 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  42.66 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08090  glycerol kinase  41.6 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000058898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  40.73 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  42.66 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0385  glycerol kinase  41.78 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  42.66 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  40.88 
 
 		 502 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1389  glycerol kinase  39.8 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  40.88 
 
 		 502 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  41.53 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  43.2 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  42.8 
 
 		 501 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  42.25 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  42.02 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  42.25 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  40.89 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  41.38 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  41.38 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  42.74 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  40.73 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  41.53 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0108  glycerol kinase  41.58 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.903611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1803  glycerol kinase  42.63 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  42.11 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  42.74 
 
 		 500 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  41.38 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  42.45 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  43.05 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  41.06 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  40.89 
 
 		 503 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  42.19 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  44.49 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  40.36 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  40.97 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  41.75 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1461  glycerol kinase  39.19 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  42.45 
 
 		 494 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  40.73 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  41.72 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1491  glycerol kinase  41.01 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  42.51 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  43.67 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2403  glycerol kinase, putative  44.92 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  41.58 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  41.62 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2595  glycerol kinase  41.82 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  41.1 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  40.94 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  40.56 
 
 		 505 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  40.76 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  40.52 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  41.92 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  41.53 
 
 		 496 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  42.54 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  41.51 
 
 		 499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  42.51 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  42.94 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  41.28 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  42.42 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  41.51 
 
 		 499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1531  glycerol kinase  40.76 
 
 		 504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403909  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  41.87 
 
 		 489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>