80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0880 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0880  condensation domain-containing protein  100 
 
 
416 aa  861    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0198363  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3898  condensation domain protein  34.15 
 
 
415 aa  199  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6240  condensation domain-containing protein  31.57 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217969  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5736  condensation domain-containing protein  33 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6489  condensation domain-containing protein  32.84 
 
 
417 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6242  condensation domain-containing protein  28.82 
 
 
406 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2503  condensation domain protein  28.44 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1443  Alcohol acetyltransferase  23.67 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4452  alcohol acetyltransferase  23.73 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3214  hypothetical protein  21.35 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128156  normal  0.655309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21000  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242529  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
769 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.43 
 
 
1829 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1444  condensation domain protein  20.62 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.14 
 
 
3432 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  31.01 
 
 
3410 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  28.57 
 
 
3021 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  35.54 
 
 
1074 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  26.9 
 
 
4196 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.69 
 
 
6403 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 
2679 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  26.17 
 
 
1801 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.76 
 
 
1839 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  28.93 
 
 
3337 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  28.86 
 
 
2619 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  25.18 
 
 
1769 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  41.67 
 
 
4531 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.22 
 
 
1806 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  34.45 
 
 
3247 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  29.19 
 
 
2155 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  26.43 
 
 
5596 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  28.4 
 
 
5929 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  51.92 
 
 
3235 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  31.25 
 
 
856 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.46 
 
 
7310 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  31.25 
 
 
856 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0240393 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  29.93 
 
 
6919 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12404  peptide synthetase mbtF  28.99 
 
 
1461 aa  47  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.49 
 
 
6676 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.11 
 
 
4747 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3465  amino acid adenylation  30.15 
 
 
1461 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126363  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  23.63 
 
 
2997 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  28.95 
 
 
7712 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.91 
 
 
2448 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3528  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 
1461 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.567451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  29.93 
 
 
1071 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0467  amino acid adenylation domain protein  23.57 
 
 
2105 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  24.73 
 
 
1745 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  26.36 
 
 
3018 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  34.92 
 
 
2638 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.15 
 
 
1460 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  24.57 
 
 
1745 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  26.32 
 
 
2867 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 
4354 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4894  amino acid adenylation domain-containing protein  27.34 
 
 
1083 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950239  normal  0.0263577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  24.57 
 
 
1745 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  29.5 
 
 
1726 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 
8211 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  24.01 
 
 
1864 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.4 
 
 
3470 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  27.27 
 
 
4478 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  28.4 
 
 
843 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.39 
 
 
1833 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.33 
 
 
4136 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  27.13 
 
 
4101 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1928  hypothetical protein  26.71 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  29.05 
 
 
4106 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  28.08 
 
 
2883 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3431  amino acid adenylation domain protein  38.1 
 
 
1813 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.8 
 
 
7541 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 
1114 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  21.76 
 
 
3207 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  21.51 
 
 
2894 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  27.33 
 
 
5372 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  29.08 
 
 
1305 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.63 
 
 
6661 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  22.77 
 
 
1762 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  25.93 
 
 
2174 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  28.39 
 
 
2561 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5070  phosphopantetheine-binding  44.83 
 
 
486 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.768749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>