More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0058 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
337 aa  688    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  34.11 
 
 
353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
358 aa  119  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
351 aa  116  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.47 
 
 
327 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.12 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  32.03 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.03 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.03 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  32.03 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.6 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  51.4 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  32.7 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.39 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0098  glycosyltransferase-like protein  28.84 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000850354 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  41.04 
 
 
326 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
355 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  38.52 
 
 
697 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  40.62 
 
 
349 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  43.86 
 
 
1157 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.84 
 
 
295 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  44.14 
 
 
1168 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  33.84 
 
 
348 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.52 
 
 
351 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  48.96 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  31.31 
 
 
785 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
316 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2094  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  46.88 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
323 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  31.92 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  36.13 
 
 
1169 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  45.65 
 
 
344 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.88 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  31.16 
 
 
321 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  32.54 
 
 
1173 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  39.69 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  29 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
348 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.37 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  46.15 
 
 
1148 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
341 aa  92.8  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  41.11 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  26.36 
 
 
325 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.98 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.91 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  46.88 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.21 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  34.63 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  28.9 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.68 
 
 
616 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  42.71 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
386 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
333 aa  89.4  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
330 aa  89.4  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
704 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  27.22 
 
 
344 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  40 
 
 
272 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.95 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  46.07 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
553 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  43.48 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  42.86 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  27.22 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.13 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 
305 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 
344 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 
351 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  42.73 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  27.22 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  27.22 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.75 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  27.6 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 
397 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
403 aa  85.9  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1431  glycosyltransferase-like protein  31.28 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  28.84 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  38.95 
 
 
155 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  41.49 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.32 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>