33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0194 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  69.4 
 
 
502 aa  732    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1062    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  40.66 
 
 
307 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  36.56 
 
 
282 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  35.4 
 
 
310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  35.05 
 
 
309 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  35.07 
 
 
309 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  42.23 
 
 
252 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  34.59 
 
 
309 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  32.89 
 
 
310 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  33.23 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  32.72 
 
 
271 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  33.69 
 
 
268 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  29.13 
 
 
334 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  34.74 
 
 
313 aa  107  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  28.48 
 
 
344 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  29.84 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  28.63 
 
 
755 aa  74.3  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  25.09 
 
 
591 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  27.86 
 
 
471 aa  72.8  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  27.82 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0853  hypothetical protein  27.49 
 
 
278 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  36.45 
 
 
287 aa  58.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  26.89 
 
 
293 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5635  hypothetical protein  26.14 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272389  normal  0.403881 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5793  hypothetical protein  26.14 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  1.8422799999999998e-21  hitchhiker  8.24928e-21 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0357  hypothetical protein  28.74 
 
 
304 aa  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000411599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2265  hypothetical protein  27.49 
 
 
263 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2473  hypothetical protein  31.07 
 
 
160 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211459  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3391  hypothetical protein  31.37 
 
 
155 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  27.35 
 
 
161 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1150  hypothetical protein  32.29 
 
 
159 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000191429  normal  0.193779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  28.85 
 
 
555 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>