25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1856 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1108    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  38.76 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  36.1 
 
 		 466 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  38.52 
 
 		 510 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  35.36 
 
 		 464 aa  310  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  37.88 
 
 		 476 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  35.16 
 
 		 474 aa  293  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  36.75 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  36.8 
 
 		 542 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  32.2 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  35.21 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  33.99 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  31.52 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  31.26 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  26.08 
 
 		 439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  26.24 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  28.42 
 
 		 534 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  35.9 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  29.86 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  32.74 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  26.83 
 
 		 462 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  30.53 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  31.96 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  27.07 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  38.16 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>