28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1465 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.98 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  49.48 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  49.48 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  52.58 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  40.43 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  34.02 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  33.66 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  33.33 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  30.39 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  35.29 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  34.31 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  28.89 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  31.73 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  32.35 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  31.37 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  29.7 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  27.84 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  26.8 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  26.8 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  28.12 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>