18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0860 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0860  protein TolA  100 
 
 		 323 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000165303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  40.35 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  28.05 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  42.2 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2449 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0691  putative periplasmic protein  25.16 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00126831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  36.51 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  26.41 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0279  TonB family protein  40.45 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.219995  unclonable  0.00000796861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  58.54 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  26.56 
 
 		 3392 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  25.13 
 
 		 1088 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  36.9 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  27.23 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0204  TonB family protein  22.83 
 
 		 245 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000615239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  26.19 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  30 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  33.7 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>