25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3125 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1038    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  38.37 
 
 
591 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  36.12 
 
 
521 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  32.18 
 
 
509 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  30.47 
 
 
509 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  28.06 
 
 
492 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  27.13 
 
 
536 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  24.93 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  27.89 
 
 
550 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  24.87 
 
 
558 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  24.56 
 
 
545 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  25.32 
 
 
552 aa  84  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  28.65 
 
 
586 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  24.94 
 
 
551 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  25.19 
 
 
551 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  23.9 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  24.86 
 
 
550 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  26.18 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  26.22 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  23.8 
 
 
552 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  24.37 
 
 
542 aa  63.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  24.51 
 
 
548 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  26.44 
 
 
547 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  22.78 
 
 
624 aa  57.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  24.92 
 
 
477 aa  50.4  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>