19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2495 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2495  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1303    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  49.48 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  23.83 
 
 
533 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3031  hypothetical protein  80 
 
 
70 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  23.72 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.82 
 
 
530 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  23 
 
 
571 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  25.69 
 
 
251 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  29.7 
 
 
374 aa  50.8  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2274  AAA ATPase  23.53 
 
 
602 aa  47.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.363979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  37.84 
 
 
572 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  31.11 
 
 
506 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  33.68 
 
 
586 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  38.3 
 
 
452 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  25.66 
 
 
461 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.45 
 
 
588 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  40.82 
 
 
544 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.99 
 
 
666 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  27.43 
 
 
789 aa  43.9  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>