63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0285 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  100 
 
 		 366 aa  713    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  31.56 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  27.08 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  31.4 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  26.32 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  29.47 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  26.94 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.21 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.21 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  23.21 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  26.67 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  27.6 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  27.13 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  29.88 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  25.41 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  29.34 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  24.67 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  23.93 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  23.51 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  26.2 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  29.03 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  30.34 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  25.17 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  22.92 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  25.17 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  25.19 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  24.71 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  29.13 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  29.69 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  31.13 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  22.89 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  24.01 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  29.96 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  30.77 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  29.84 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  23.01 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  25.35 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  26.07 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  25.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  33.66 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  33 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  28.47 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  29.66 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  25.97 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  28.11 
 
 		 207 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  28.47 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  31.67 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  32.4 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  24.59 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  22.76 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  22.76 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  26.83 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  22.13 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  22.76 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  21.74 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  25.67 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  27.05 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  33.61 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  34.74 
 
 		 513 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  24.27 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1737  high-affinity nickel-transporter  29.52 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  34.12 
 
 		 501 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  41.18 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>