25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1692 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1692  putative lipoprotein  100 
 
 
98 aa  205  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1725  putative lipoprotein  65.17 
 
 
102 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2379  putative lipoprotein  55.88 
 
 
105 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.163248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2663  hypothetical protein  55.88 
 
 
105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0170256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1771  putative lipoprotein  50.98 
 
 
105 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0555699  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2556  putative lipoprotein  50.98 
 
 
105 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0857422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1879  hypothetical protein  50.98 
 
 
104 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2217  putative lipoprotein  46.46 
 
 
100 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1727  lysozyme inhibitor  35.92 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0360001  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1544  lysozyme inhibitor  35.92 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.412708  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1617  lysozyme inhibitor  35.92 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  0.640497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1557  lysozyme inhibitor  35.92 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.833119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1896  lysozyme inhibitor  35.92 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2351  lysozyme inhibitor  37.86 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0205035  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1560  lysozyme inhibitor  36.89 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1990  lysozyme inhibitor  36.89 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1715  lysozyme inhibitor  36.89 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.19796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2001  putative lipoprotein  36.89 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000221904  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01609  predicted lipoprotein  36.89 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01599  hypothetical protein  36.89 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1831  lysozyme inhibitor  36.89 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927133  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1849  lysozyme inhibitor  36.89 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000107016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1809  lysozyme inhibitor  32.04 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0953992  hitchhiker  0.00103718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2453  secreted protein-like protein  47.83 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0178  hypothetical protein  32 
 
 
104 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000306154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>