204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1263 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1263  aspartate racemase  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00631674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2731  aspartate racemase  71.43 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1778  aspartate racemase  66.38 
 
 		 238 aa  327  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1378  aspartate racemase  66.67 
 
 		 238 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2004  aspartate racemase  44.87 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.272891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4912  aspartate racemase  48.9 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  0.107391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4766  aspartate racemase  48.9 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.782175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4865  aspartate racemase  48.9 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.629158  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4914  aspartate racemase  48.9 
 
 		 244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4841  aspartate racemase  48.9 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1090  aspartate racemase  45.81 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0629  aspartate racemase  39.04 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.578464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2741  aspartate racemase  42.13 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0308  aspartate racemase  41.79 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4295  aspartate racemase  40.95 
 
 		 250 aa  154  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.0102162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3504  aspartate racemase  37.67 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3003  aspartate racemase  36.21 
 
 		 518 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.145787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3987  aspartate racemase  37.22 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767014  normal  0.191158 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1302  aspartate racemase  37.29 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00152087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1405  aspartate racemase  37.25 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1803  aspartate racemase  35.78 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1720  aspartate racemase  36.77 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.377946  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4701  aspartate racemase  35.43 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0254125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5944  aspartate racemase  35.62 
 
 		 489 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4590  aspartate racemase  34.98 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0144088  normal  0.0378027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1731  aspartate racemase  36.28 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0565132  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5991  aspartate racemase  35.71 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6217  aspartate racemase  34.2 
 
 		 484 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1511  aspartate racemase  33.19 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6736  aspartate racemase  35.59 
 
 		 497 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5339  aspartate racemase  34.33 
 
 		 487 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302098  normal  0.0375198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2001  aspartate racemase  35.94 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4384  aspartate racemase  33.19 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1034  aspartate racemase  31.72 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00115826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2418  aspartate racemase  31.58 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.790687  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5638  aspartate racemase  34.75 
 
 		 499 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3108  aspartate racemase  34.93 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1886  aspartate racemase  32.76 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1573  aspartate racemase  33.16 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0521541  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4736  aspartate racemase  34.6 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3181  aspartate racemase  31.11 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0452  aspartate racemase  32.16 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000396457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2531  aspartate racemase  29.49 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1547  aspartate racemase  32.7 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3404  aspartate racemase  30.71 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.568997 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0282  aspartate racemase  29.56 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0374  probable amino-acid racemase  29.91 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4889  probable amino-acid racemase  30.87 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1663  aspartate racemase  33.05 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.977225  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4503  aspartate racemase  30 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1222  aspartate racemase  27.75 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4865  aspartate racemase family protein  29.61 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0465  aspartate racemase  29.24 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1048  aspartate racemase  30.88 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.688459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4485  aspartate racemase  30 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4583  aspartate racemase  28.33 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4873  probable amino-acid racemase  29.39 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4895  aspartate racemase family protein  29.13 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2501  aspartate racemase  26.11 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00208009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  25.45 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0071  aspartate racemase  29.15 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.937931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  30.13 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  25.45 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4650  aspartate racemase family protein  28.15 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5005  aspartate racemase family protein  28.15 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0212  putative aspartate racemase protein  26.24 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.314318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  25.45 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  25.6 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  24.22 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  24.22 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  25.89 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  24.22 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  25.89 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0560  aspartate racemase  29.05 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0477759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  28.7 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3053  aspartate racemase  26.73 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  24.64 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  24.22 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  26.54 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  27.7 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  25.11 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  25.11 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0557  aspartate racemase  27.7 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  30.5 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  30.5 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  24.15 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3426  aspartate racemase  27.04 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  29.22 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  25.79 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0528  aspartate racemase  27.7 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  25.34 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  28.57 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1766  aspartate racemase  23.88 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  27.27 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  27.27 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1732  aspartate racemase  29.76 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000037531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  27.27 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0870  aspartate racemase  24.68 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0325955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1020  aspartate racemase  25.24 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  25.82 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>