22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0980 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1314  hypothetical protein  39.42 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576469  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1713  hypothetical protein  35.82 
 
 
318 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.717122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1555  hypothetical protein  26.23 
 
 
303 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  27.27 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  28.53 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  35.92 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  26.82 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  26.42 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  26.42 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  26.72 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  26.42 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  26.01 
 
 
389 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5951  poly(aspartic acid) hydrolase  28.7 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  26.88 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  30.25 
 
 
373 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  29.63 
 
 
375 aa  49.3  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  25.46 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1447  hypothetical protein  29.57 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.101367  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  22.93 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  22.93 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  26.49 
 
 
373 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>