More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2705 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2705  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 317 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1289  transcriptional regulator CysB-like protein  84.23 
 
 		 317 aa  537  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  81.7 
 
 		 317 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  81.7 
 
 		 317 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2917  transcriptional regulator CysB-like protein  77.92 
 
 		 317 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  69.09 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  69.09 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  69.09 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  69.09 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000889139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  68.77 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000101541  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2110  transcriptional regulator Cbl  68.77 
 
 		 316 aa  447  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.3178700000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  68.77 
 
 		 316 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  68.45 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000765107  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  69.09 
 
 		 316 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142733  hitchhiker  0.0000552963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2563  transcriptional regulator Cbl  68.45 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00294474  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  58.88 
 
 		 309 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  58.22 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  56.29 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 308 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  351  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  52.96 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  52.96 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  53.33 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  53.33 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  53.33 
 
 		 308 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  53.33 
 
 		 308 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  55.08 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 312 aa  341  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  53.31 
 
 		 315 aa  331  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  49.84 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  50.66 
 
 		 319 aa  315  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  48.67 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  50.33 
 
 		 319 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  50 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  51.94 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  52.16 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  46.84 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  46.84 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  46.84 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  46.84 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  46.18 
 
 		 313 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  46.51 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  46.51 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  45.82 
 
 		 326 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  47.81 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  45.34 
 
 		 313 aa  295  9e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  46.13 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  46.03 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  46.73 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  45.7 
 
 		 313 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  47.71 
 
 		 323 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  45.95 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  46.13 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  45.63 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  44.37 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  45.28 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  45.28 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  45.18 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  45.45 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  45.18 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  45.79 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  47.51 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  45.36 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  45.83 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  46.71 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  46.82 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  44.55 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  44.23 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  44.23 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  44.23 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  46.67 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  44.87 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  44.55 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  44.87 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  44.87 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  44.87 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  44.87 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  44.87 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  44.23 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>