33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2331 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2331  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2386  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4040  hypothetical protein  44.17 
 
 
126 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.344476  normal  0.247596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3130  putative lipoprotein  34.86 
 
 
220 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4964  hypothetical protein  41.77 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2112  hypothetical protein  31.76 
 
 
106 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0484035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0357  putative lipoprotein  36.7 
 
 
219 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000581024  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0271  putative lipoprotein  31.48 
 
 
220 aa  48.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4712  hypothetical protein  26.67 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1204  hypothetical protein  34.12 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0387991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0207  hypothetical protein  26.74 
 
 
113 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1847  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2138  hypothetical protein  32.2 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1119  hypothetical protein  30.7 
 
 
115 aa  43.9  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331075  normal  0.672646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1373  hypothetical protein  31.76 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0594  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.40048e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1085  hypothetical protein  34.57 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000148466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4481  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2189  hypothetical protein  27.38 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1634  hypothetical protein  29.41 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01368  hypothetical protein  22.35 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2272  hypothetical protein  22.35 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01355  hypothetical protein  22.35 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2429  hypothetical protein  27.38 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1470  hypothetical protein  22.35 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1044  hypothetical protein  34.57 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00482729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6079  hypothetical protein  32.18 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70050  hypothetical protein  32.18 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2062  hypothetical protein  27.38 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1568  hypothetical protein  22.62 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2171  hypothetical protein  32.95 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.224547  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2168  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.452703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>