47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1378 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1378  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 435 aa  841    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.558365  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1277  iron-sulfur binding protein  47.1 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000111137  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.87 
 
 		 539 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149856  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2389  iron-sulfur cluster-binding protein  45.17 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0525  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.9 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1009  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.94 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0578  hypothetical protein  27.09 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.746037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  24.49 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 232 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  22.73 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  28.95 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2955  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.85 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00620817  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2123  regulatory protein NosR  25.24 
 
 		 710 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2263  transcription regulator NosR  25.24 
 
 		 710 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.14 
 
 		 247 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23 
 
 		 288 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.71 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2317  regulatory protein nosR, putative  24.68 
 
 		 713 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.980481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0987  regulatory protein nosR, putative  25 
 
 		 710 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  27.59 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0347  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.326177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0601  aminoglycoside phosphotransferase-like protein  25.41 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0545044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2068  regulatory protein NosR  24.92 
 
 		 710 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.927633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  27.75 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0836  hydrogenase large subunit domain protein  28.09 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000619385  hitchhiker  0.000460922 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0089  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.59 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.194579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.63 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1551  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.5 
 
 		 289 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2242  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  33.33 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.55 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  34.44 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  21.33 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0729  iron-sulfur cluster-binding protein  33.8 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  33.33 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  20.79 
 
 		 240 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  25.79 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0985  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.91 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01385  conserved ferredoxin-related protein  33.33 
 
 		 633 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.43 
 
 		 588 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1570  Iron-sulfur cluster-binding protein  33.8 
 
 		 320 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018133  normal  0.554511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.46 
 
 		 290 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.68 
 
 		 144 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1351  iron-sulfur cluster-binding protein  32.53 
 
 		 322 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1978  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.78 
 
 		 314 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.996407  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1816  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 131 aa  43.1  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.149378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>