More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0292 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
292 aa  565  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.9 
 
 
325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  48.43 
 
 
305 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  50.52 
 
 
341 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  46.71 
 
 
289 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.77 
 
 
292 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  40 
 
 
311 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  40.14 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  39.39 
 
 
328 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  39.66 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  39.86 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  40.41 
 
 
310 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  40.07 
 
 
310 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  39.62 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  36.91 
 
 
315 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  32.51 
 
 
312 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.71 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.35 
 
 
303 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  29.14 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.71 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.35 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.35 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.99 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.99 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.99 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.99 
 
 
303 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  29.14 
 
 
309 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.99 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.62 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.62 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  32.13 
 
 
286 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  29.41 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  28.42 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  28.57 
 
 
311 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.24 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.24 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.77 
 
 
286 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  31.21 
 
 
301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 
286 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
302 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
309 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  28.62 
 
 
310 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.98 
 
 
310 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  28.98 
 
 
310 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
310 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  28.98 
 
 
310 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  28.18 
 
 
310 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.14 
 
 
300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
300 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  31.82 
 
 
314 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.97 
 
 
304 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.67 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  29.49 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  31.21 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  29.82 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  32.61 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.9 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.86 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.72 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.08 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.21 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.21 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.55 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.21 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.69 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.87 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.08 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
287 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.35 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.61 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  30.11 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.97 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.55 
 
 
303 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  26.15 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.21 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.8 
 
 
293 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.19 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  27.02 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  27.4 
 
 
281 aa  92  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  29.89 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  27.11 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.81 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  25.7 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  36.25 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.47 
 
 
345 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.29 
 
 
316 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  31.03 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  30.42 
 
 
287 aa  89  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  26.67 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  28.47 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  26.78 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  31.45 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>