38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1935 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1935  spore germination B3 GerAC family protein  100 
 
 		 381 aa  760    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0669  spore germination B3 GerAC like  33.5 
 
 		 436 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1969  germination protein, Ger(x)C family  28.86 
 
 		 437 aa  179  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2955  germination protein, Ger(x)C family  29.84 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1734  spore germination B3 GerAC family protein  26.65 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.525004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0523  germination protein, Ger(x)C family  23.29 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1265  germination protein, Ger(x)C family  24.27 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0584  germination protein, Ger(x)C family  23.14 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2465  germination protein, Ger(x)C family  24.6 
 
 		 401 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3201  spore germination B3 GerAC family protein, putative  20.53 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1462  spore germination B3 GerAC like  24.85 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0077  hypothetical protein  25.43 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2165  germination protein, Ger(x)C family  23.28 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.370833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0605  spore germination B3 GerAC family protein  23.58 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00120  spore germination B3 GerAC family protein  21.98 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0845  germination protein, Ger(x)C family  24.2 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3658  spore germination B3 GerAC family protein  24.54 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0249  germination protein, Ger  23.56 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0745  spore germination protein GerLC  22.32 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0138  spore germination protein KC  22.11 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0626  spore germination B3 GerAC family protein  21.99 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3281  germination protein, Ger(x)C family  20.87 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000713918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4592  spore germination protein GerLC  21.8 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0298  germination protein, Ger(x)C family  23.99 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3013  germination protein, Ger(x)C family  17.36 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1013  spore germination B3 GerAC like  24.85 
 
 		 325 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0602  germination protein, Ger(x)C family  23.56 
 
 		 419 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0268428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0059  germination protein, Ger(x)C family  21.67 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.727397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0599  spore germination B3 GerAC family protein  22.99 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0075  hypothetical protein  21.67 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2437  germination protein, Ger(x)C family  24.46 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0875  germination protein, Ger(x)C family  26.36 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0053  spore germination B3 GerAC family protein  20.77 
 
 		 402 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0839  spore germination protein LC  22.48 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2040  spore germination B3 GerAC like  24.74 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0804  spore germination B3 GerAC family protein  19.22 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.896679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2666  spore germination B3 GerAC family protein  19.02 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2767  germination protein, Ger(x)C family  19.85 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000418614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>