122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3733 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3733  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0289264  normal  0.0233298 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4300  hypothetical protein  58.49 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54030  hypothetical protein  56.88 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4728  hypothetical protein  56.88 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.691682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1655  protein of unknown function DUF81  56.15 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0152703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1421  protein of unknown function DUF81  42.38 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0361958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  35.94 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.55 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  28.31 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  31 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  35.94 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.86 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  29.02 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  29.88 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  33.72 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  35.12 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  36.16 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  32.82 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  32.82 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  29.21 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  32.31 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  29.77 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  28.37 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.79 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  29.52 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  31.76 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.08 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  30.32 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  31.08 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  29.27 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  30.65 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  26.25 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  31.36 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  24.34 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  28.27 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  27.85 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  30.69 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.38 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  31.78 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  28.24 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  30.18 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  29.07 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  29.55 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  24.54 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  25.42 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1051  hypothetical protein  31.86 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  27.54 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  25.45 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  27.04 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  26.98 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  27.66 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  28.21 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  32.02 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  24.89 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  32.92 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  30.86 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  28.3 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  28.04 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  31.35 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  29.17 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  27.39 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  27.78 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  28.35 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  28.35 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  26.32 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  28.63 
 
 		 267 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  25.93 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  26.82 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01459  membrane protein  25.27 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  30.46 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  27.53 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  28.12 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  25.22 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  27.63 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>