37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2857 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  100 
 
 
57 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  62.07 
 
 
396 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  62.26 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  53.45 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  53.45 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  54.39 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  56.14 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  53.45 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  54.39 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  51.72 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  52.63 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  62.75 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  53.57 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  53.57 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  56.67 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  50.88 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  65.96 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  52.83 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  56.86 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  53.57 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  58.82 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  62.79 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  61.7 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  51.79 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  53.85 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  52.94 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  48.44 
 
 
301 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  54.17 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  57.14 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  47.17 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  44.68 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  51.02 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  48.98 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  48.98 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  47.62 
 
 
133 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>