More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2031 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
301 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  71 
 
 
300 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  71 
 
 
300 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  68.98 
 
 
304 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  64.21 
 
 
300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.21 
 
 
299 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  60.73 
 
 
305 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  64.21 
 
 
299 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  59.08 
 
 
304 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  57.24 
 
 
306 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  57.1 
 
 
304 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  48.33 
 
 
304 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  48.85 
 
 
304 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  48.51 
 
 
304 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  49.34 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  48.84 
 
 
304 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  43.79 
 
 
307 aa  248  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  42.67 
 
 
306 aa  243  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  41.69 
 
 
306 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
302 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  33.91 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  34.63 
 
 
259 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  32.56 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  35.37 
 
 
425 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.96 
 
 
241 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  32.26 
 
 
269 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.14 
 
 
237 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
279 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
255 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  34.72 
 
 
267 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.77 
 
 
267 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
263 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  33.77 
 
 
267 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.36 
 
 
276 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  29.58 
 
 
256 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.85 
 
 
250 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  35.41 
 
 
256 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  32.92 
 
 
264 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  33.64 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  34.2 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  32.39 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.35 
 
 
394 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.73 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  33.06 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
415 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  37.18 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
478 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  37.18 
 
 
259 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.36 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.14 
 
 
517 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
252 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.57 
 
 
247 aa  92.4  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  33.62 
 
 
466 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.06 
 
 
482 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  34.45 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.68 
 
 
516 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  34.19 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  31.05 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  31.05 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  31.95 
 
 
253 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  31.84 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  34.84 
 
 
505 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 
236 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  35.06 
 
 
463 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  34.23 
 
 
491 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.23 
 
 
491 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.23 
 
 
491 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 
470 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  31.05 
 
 
250 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  32.08 
 
 
238 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 
477 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 
395 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
597 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
256 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
256 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  33.04 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  30.65 
 
 
250 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  30.65 
 
 
250 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  30.65 
 
 
250 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  30.65 
 
 
250 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  34.35 
 
 
441 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3143  protein serine/threonine phosphatases  31.89 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000847096  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  33.76 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  33.48 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  30.94 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  31.44 
 
 
313 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  31.44 
 
 
252 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  30.71 
 
 
633 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.03 
 
 
245 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0002  protein serine/threonine phosphatase  29.84 
 
 
617 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.818409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  36.48 
 
 
234 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  30.86 
 
 
435 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  32.72 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  32.02 
 
 
538 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
270 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>