32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1610 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  100 
 
 		 493 aa  1004    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  36.05 
 
 		 534 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2427  polyphenol oxidase b precursor (catechol oxidase) oxidoreductase protein  35.45 
 
 		 506 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  32.33 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  31.77 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  31.9 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  29.01 
 
 		 548 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  30.17 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  29.41 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  28.65 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  31.07 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  25.87 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0649  tyrosinase (monophenol monooxygenase)  30.95 
 
 		 535 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0985118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  34.09 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0806  tyrosinase  34.09 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2352  putative tyrosinase  34.09 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  25.86 
 
 		 247 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  25.86 
 
 		 247 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  28.5 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  27.31 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  27.27 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  29.44 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  30.19 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  52.27 
 
 		 850 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.71 
 
 		 690 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.833973  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  24.57 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  25 
 
 		 971 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  25.26 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  26.98 
 
 		 874 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07060  tyrosinase (AFU_orthologue; AFUA_1G17430)  33.62 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.044074  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06442  amino acid transporter (Eurofung)  23.98 
 
 		 904 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1838  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.327344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>