36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1177 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1177  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  557  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0981  alpha/beta hydrolase fold  67.43 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3416  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0827  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0238202  normal  0.253698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2582  hypothetical protein  35.83 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132129  normal  0.148491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2007  hypothetical protein  34.75 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.513637  normal  0.995132 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0775  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.841147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3735  hypothetical protein  33.59 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  23.95 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.71 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2198  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00385806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.23 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.23 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.23 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  23.64 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  23.64 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.61 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  23.46 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  24.81 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  23.98 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1200  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  22.69 
 
 		 320 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  36.36 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  36.36 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  21.63 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 300 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>