33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3703 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3703  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
248 aa  500  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1510  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.59 
 
 
256 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000966979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0924  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.92 
 
 
256 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0951  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.33 
 
 
256 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1974  condensin subunit ScpA  45.45 
 
 
278 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.776999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3421  condensin subunit ScpA  42.49 
 
 
274 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1145  condensin subunit ScpA  41.79 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595963  hitchhiker  0.00600954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1848  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.21 
 
 
286 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.448814  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01671  hypothetical protein  36.8 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02231  hypothetical protein  36.73 
 
 
297 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1517  hypothetical protein  37.09 
 
 
297 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2403  putative segregation and condensation protein A  36.68 
 
 
300 aa  129  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.389122  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0290  putative segregation and condensation protein A  38.08 
 
 
307 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26721  hypothetical protein  43.12 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01701  hypothetical protein  34.1 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01681  hypothetical protein  32.18 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.450973  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0153  hypothetical protein  32.57 
 
 
273 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01791  hypothetical protein  33.73 
 
 
277 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0748  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0457996  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0593  condensin subunit ScpA  26.27 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.06 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1011  condensin subunit ScpA  27.31 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2184  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.43 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0026  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.92 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2737  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.25 
 
 
299 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.577112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2588  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 
405 aa  63.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342818  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.67 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1498  condensin subunit ScpA  25.75 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00138218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0018  chromosome segregation and condensation protein ScpA  20.9 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1340  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.87 
 
 
386 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0528  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.67 
 
 
322 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769453  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3001  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.44 
 
 
364 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.428168  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0829  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.59 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>