25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5135 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 
114 aa  224  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  45.45 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  44.55 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  42.73 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  40.91 
 
 
119 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  42.73 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  42.99 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  33.94 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  44.55 
 
 
115 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.73 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  39.09 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  37.27 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.29 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  34.26 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  34.86 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  33.03 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  33.93 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  33.93 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  28.85 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  30.28 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1130  hypothetical protein  32.77 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0165  TfoX domain-containing protein  26.73 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  29.07 
 
 
128 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>