26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1406 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  68.75 
 
 		 223 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  68.89 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1142  hypothetical protein  67.25 
 
 		 229 aa  291  5e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0728659  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  59.38 
 
 		 225 aa  277  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  53.88 
 
 		 222 aa  249  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  53.18 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  40.94 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  31.05 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  30.29 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  30.05 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  30.54 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  34.59 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  26.8 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5613  hypothetical protein  26.75 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03570  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.705996  normal  0.134532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3374  hypothetical protein  30.16 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0121644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2306  hypothetical protein  25.98 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000512455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  23.81 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0470029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3312  hypothetical protein  31.96 
 
 		 176 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0872079  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0040  MgtC family protein  25.68 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0035  MgtC family protein  25.68 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  28.81 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>