37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0863 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  100 
 
 
236 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  42.93 
 
 
195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  42.39 
 
 
195 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  41.85 
 
 
195 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  40.22 
 
 
195 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  40.22 
 
 
195 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  40.22 
 
 
195 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  40.84 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  39.67 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  42.93 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  42.93 
 
 
195 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  42.39 
 
 
195 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  42.19 
 
 
195 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  30.53 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  29.84 
 
 
432 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  28.42 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  27.69 
 
 
185 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  28.35 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7393  yecA family protein  32.58 
 
 
336 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147246  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7276  yecA family protein  32.58 
 
 
336 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  26.47 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1161  metal-binding protein  27.27 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  29.22 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1195  yecA family protein  26.49 
 
 
183 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  30.47 
 
 
221 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  27.27 
 
 
221 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  25.52 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  29.69 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  29.69 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  29.69 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  29.69 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  29.69 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  27.08 
 
 
198 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  26.58 
 
 
259 aa  42  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  22.43 
 
 
267 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>