20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6344 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6344  AAA ATPase  100 
 
 		 537 aa  1095    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4015  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  28.84 
 
 		 556 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00360  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  29 
 
 		 636 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0479  ABC transporter ATP-binding protein  26.76 
 
 		 336 aa  90.5  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.990168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  23.26 
 
 		 976 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  24.79 
 
 		 256 aa  50.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  26.47 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.34 
 
 		 736 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  25.11 
 
 		 256 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  23.08 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.11 
 
 		 243 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.744686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  22.13 
 
 		 340 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.08 
 
 		 708 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  26.09 
 
 		 224 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32 
 
 		 430 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  26.62 
 
 		 769 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  25.64 
 
 		 515 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  33.77 
 
 		 388 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  28.24 
 
 		 450 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.48 
 
 		 248 aa  43.5  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>