More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2017 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3498  ABC transporter related  65.93 
 
 
225 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.552315 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2451  ABC transporter related  65.62 
 
 
223 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16471  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2387  ABC transporter related  64.73 
 
 
223 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.41405  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  64.29 
 
 
223 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0733  cell division ATP-binding protein FtsE  64.29 
 
 
223 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0478  ABC transporter related  67.26 
 
 
225 aa  287  9e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  50.23 
 
 
235 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.640793  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 
219 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1997  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 
219 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  48.87 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3572  cell division ATP-binding protein FtsE  47.96 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  0.091896 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0100  cell division ATP-binding protein FtsE  47.62 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2892  ABC transporter related  47.06 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  50.75 
 
 
285 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3013  cell division ATP-binding protein FtsE  50.75 
 
 
235 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563056  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  49.05 
 
 
219 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1595  cell division ATP-binding protein FtsE  53.69 
 
 
219 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  51.22 
 
 
207 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3217  cell division ATP-binding protein FtsE  48.56 
 
 
260 aa  191  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11249  normal  0.222957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0362  cell division ATP-binding protein FtsE  52 
 
 
220 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0943  ABC transporter related  47.96 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0834  ABC transporter related  47.96 
 
 
219 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.389037  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5218  cell division ATP-binding protein FtsE  47.96 
 
 
219 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  48.42 
 
 
219 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  47.96 
 
 
220 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0701  ABC transporter related  45.02 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2543  cell division ATP-binding protein FtsE  47.51 
 
 
227 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772851  normal  0.715925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3091  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 
231 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  49.77 
 
 
232 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3254  ABC transporter component  49.25 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  47.09 
 
 
237 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  47.09 
 
 
253 aa  178  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  47.09 
 
 
237 aa  177  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3084  cell division ATP-binding protein FtsE  50.27 
 
 
223 aa  170  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4867  ABC transporter related  48.87 
 
 
219 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.459104  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0576  ABC transporter, ATPase subunit  49.77 
 
 
219 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0667  ABC transporter related  49.32 
 
 
219 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0394716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  44.71 
 
 
227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  42.31 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3022  cell division ATP-binding protein FtsE  43.27 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.94484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0245  hypothetical protein  39.42 
 
 
227 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  41.59 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  42.01 
 
 
223 aa  161  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  40.87 
 
 
229 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0244  cell division ATP-binding protein FtsE  42.11 
 
 
249 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  42.66 
 
 
229 aa  161  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2980  cell division ATP-binding protein FtsE  49.26 
 
 
230 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135492  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5034  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  36.07 
 
 
228 aa  161  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4864  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
228 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07700  cell division ATP-binding protein FtsE  42.66 
 
 
229 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75287  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5290  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  35.62 
 
 
228 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  36.07 
 
 
228 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1914  type II secretory pathway family protein  43.75 
 
 
229 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153885  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1453  cell-division ATP-binding protein  41.83 
 
 
229 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  41.55 
 
 
223 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5302  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  35.62 
 
 
228 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4879  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
228 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0296  putative cell division ATP-binding protein FtsE  36.45 
 
 
228 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000631483  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1866  cell division ATP-binding protein FtsE  38.6 
 
 
226 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0534138  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  43 
 
 
226 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  36.45 
 
 
228 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  35.89 
 
 
228 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4006  cell division ATP-binding protein FtsE  41.35 
 
 
246 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  39.25 
 
 
228 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4448  type II secretory pathway family protein  43.27 
 
 
229 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0945  cell division ATP-binding protein FtsE  42.31 
 
 
229 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  42.03 
 
 
223 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0284  cell division ATP-binding protein FtsE  42.06 
 
 
228 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.931477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0793  cell division ATP-binding protein FtsE  41.35 
 
 
229 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.475778  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0578  ATPase  41.29 
 
 
231 aa  155  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0490127  normal  0.247992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1058  cell division ATP-binding protein FtsE  39.91 
 
 
230 aa  156  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  42.01 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  41.83 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3945  cell division ATP-binding protein FtsE  42.16 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000529058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  40.87 
 
 
229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.402679  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0864  cell division ATP-binding protein FtsE  41.23 
 
 
251 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  42.5 
 
 
237 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0700  cell division ATP-binding protein FtsE  44.55 
 
 
234 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0701  cell division ATP-binding protein FtsE  44.55 
 
 
234 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3189  cell division ATP-binding protein FtsE  37.32 
 
 
232 aa  154  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  39.25 
 
 
235 aa  154  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0666  cell division ATP-binding protein FtsE  44.44 
 
 
232 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.73828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2769  cell division ATP-binding protein FtsE  41.35 
 
 
229 aa  154  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5416  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  36.63 
 
 
214 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  37.73 
 
 
226 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5272  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  36.63 
 
 
214 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.995726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  42.31 
 
 
229 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1554  cell division ATP-binding protein FtsE  42.08 
 
 
216 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.154084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  42.72 
 
 
229 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  41.06 
 
 
230 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2913  cell division ATP-binding protein FtsE  40.97 
 
 
238 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  42.31 
 
 
229 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1582  cell division ATP-binding protein FtsE  42.31 
 
 
229 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0540  ABC transporter related  40.31 
 
 
241 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00247085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  38.32 
 
 
228 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4327  cell division ATP-binding protein FtsE  44.93 
 
 
223 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5654  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  36.14 
 
 
214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5347  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  36.14 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>