More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3498 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3498  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.552315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0733  cell division ATP-binding protein FtsE  68.89 
 
 		 223 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2387  ABC transporter related  68.89 
 
 		 223 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.41405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0478  ABC transporter related  67.56 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  65.93 
 
 		 224 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2451  ABC transporter related  68.58 
 
 		 223 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16471  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  62.67 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  52.05 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.640793  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3572  cell division ATP-binding protein FtsE  51.6 
 
 		 219 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  0.091896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  51.14 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_004310  BR1997  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  52.86 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  52.86 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  53.42 
 
 		 285 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1595  cell division ATP-binding protein FtsE  58.13 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3217  cell division ATP-binding protein FtsE  52.73 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11249  normal  0.222957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  51.9 
 
 		 236 aa  217  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0362  cell division ATP-binding protein FtsE  55.5 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2543  cell division ATP-binding protein FtsE  51.14 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772851  normal  0.715925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  52.79 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2892  ABC transporter related  49.77 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  53.3 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  52.97 
 
 		 231 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3013  cell division ATP-binding protein FtsE  54.5 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0943  ABC transporter related  53.33 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  52.97 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0100  cell division ATP-binding protein FtsE  47.14 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5218  cell division ATP-binding protein FtsE  52.83 
 
 		 219 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  51.6 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0834  ABC transporter related  52.38 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.389037  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  51.6 
 
 		 237 aa  203  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  51.6 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3254  ABC transporter component  52 
 
 		 258 aa  198  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0701  ABC transporter related  48.34 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  51 
 
 		 220 aa  194  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0667  ABC transporter related  54.72 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0394716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4867  ABC transporter related  53.3 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.459104  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3091  cell division ATP-binding protein FtsE  50.68 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3084  cell division ATP-binding protein FtsE  47.55 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0576  ABC transporter, ATPase subunit  53.3 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2980  cell division ATP-binding protein FtsE  53.88 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2913  cell division ATP-binding protein FtsE  43.35 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1205  cell division ATP-binding protein FtsE  41.55 
 
 		 248 aa  170  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  41.36 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  44 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  40.91 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  42.03 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  41.55 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3606  cell division ATP-binding protein FtsE  43.22 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  39.09 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  40.81 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1676  ATP-binding component of a membrane-associated cell division complex FtsE  41.29 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2988  cell division ATP-binding protein FtsE  42.27 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3945  cell division ATP-binding protein FtsE  39.46 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000529058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  36.2 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0296  putative cell division ATP-binding protein FtsE  36.2 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000631483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5290  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  37.33 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5034  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  37.33 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4864  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4879  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  39.23 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  37.73 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1058  cell division ATP-binding protein FtsE  39.55 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  39.35 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  40.18 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0659  cell division ATP-binding protein FtsE  40.3 
 
 		 248 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351977  normal  0.070101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  39.73 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5302  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  36.89 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0245  hypothetical protein  38.16 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2109  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  42 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0215  cell division ATP-binding protein  42 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.354221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  41.5 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  41.5 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  41.5 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  41.5 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07700  cell division ATP-binding protein FtsE  39.47 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  42.5 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  36 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0405  cell division ATP-binding protein FtsE  38.89 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0035586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  41 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5347  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  38.05 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0100  cell division protein FtsE  39.11 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  42.51 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3762  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5272  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  38.05 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.995726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5416  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  38.05 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3882  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.166736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3004  cell division ATP-binding protein FtsE  36.36 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000252068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3941  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3772  cell division protein FtsE  41 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1554  cell division ATP-binding protein FtsE  40.8 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.154084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4064  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  39.55 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  39.23 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3876  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  39.55 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3073  cell division ATP-binding protein FtsE  38.76 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3189  cell division ATP-binding protein FtsE  36.36 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>