More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0540 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0540  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00247085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1781  cell division ATP-binding protein FtsE  84.14 
 
 
233 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.14805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0907  ABC transporter related  79.39 
 
 
235 aa  387  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.842176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0578  ATPase  76.86 
 
 
231 aa  374  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0490127  normal  0.247992 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0807  ABC transporter-related protein  70.94 
 
 
236 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.147643  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1444  ATPase  72.1 
 
 
237 aa  349  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0717  ABC transporter related  68.42 
 
 
249 aa  337  9e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.387806  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1650  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
227 aa  230  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0762596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2245  ABC transporter related  52.45 
 
 
249 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3207  ABC transporter related  50.24 
 
 
227 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1353  hypothetical protein  49.27 
 
 
234 aa  215  4e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1660  ABC transporter related  51.55 
 
 
364 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.698685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00170  putative ATP-binding protein involved in cell division  49.5 
 
 
229 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1801  cell division ATP-binding protein FtsE  47.87 
 
 
239 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000021053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0519  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  47.37 
 
 
230 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  46.48 
 
 
229 aa  205  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5046  ABC transporter related  42.92 
 
 
226 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  45.58 
 
 
228 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2531  cell-division ATP-binding protein  43.06 
 
 
221 aa  202  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4006  cell division ATP-binding protein FtsE  45.96 
 
 
246 aa  201  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0793  cell division ATP-binding protein FtsE  46.97 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.475778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1453  cell-division ATP-binding protein  46.97 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1676  ATP-binding component of a membrane-associated cell division complex FtsE  45.62 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3028  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.166438  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  46.46 
 
 
229 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  46.46 
 
 
229 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1582  cell division ATP-binding protein FtsE  46.46 
 
 
229 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  45.28 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.402679  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6519  ABC transporter related  44.14 
 
 
230 aa  197  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13119  cell division ATP-binding protein ftsE  45.69 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.762863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3073  cell division ATP-binding protein FtsE  43.53 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0296  putative cell division ATP-binding protein FtsE  45.71 
 
 
228 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000631483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3453  cell division ATP-binding protein FtsE  45.15 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07700  cell division ATP-binding protein FtsE  46.23 
 
 
229 aa  194  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75287  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  45.5 
 
 
228 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2665  cell division ATP-binding protein FtsE  44.55 
 
 
273 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1914  type II secretory pathway family protein  44.39 
 
 
229 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153885  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4587  cell division ATP-binding protein FtsE  49.47 
 
 
329 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387593  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  43.81 
 
 
228 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  46.94 
 
 
226 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4448  type II secretory pathway family protein  44.39 
 
 
229 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2400  cell division ATP-binding protein FtsE  44.13 
 
 
262 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0253166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3189  cell division ATP-binding protein FtsE  44.44 
 
 
232 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  46.94 
 
 
238 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1058  cell division ATP-binding protein FtsE  45 
 
 
230 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  44.93 
 
 
228 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0945  cell division ATP-binding protein FtsE  46.7 
 
 
229 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1761  cell division ATP-binding protein FtsE  46.11 
 
 
231 aa  191  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0284  cell division ATP-binding protein FtsE  45.92 
 
 
228 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.931477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1101  cell division ATP-binding protein  43.81 
 
 
235 aa  191  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.760919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1234  cell division ATP-binding protein FtsE  46.73 
 
 
229 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3004  cell division ATP-binding protein FtsE  46.35 
 
 
228 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000252068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2190  cell-division ATP-binding protein  46.38 
 
 
246 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3022  cell division ATP-binding protein FtsE  43.9 
 
 
229 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.94484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  44.13 
 
 
229 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1996  cell division ATP-binding protein FtsE  44.67 
 
 
244 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.736099  hitchhiker  0.00509364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1606  cell division ATP-binding protein FtsE  43.4 
 
 
228 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  44.44 
 
 
228 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1677  cell division ATP-binding protein FtsE  46.38 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202912  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20330  cell division ATP-binding protein FtsE  45.45 
 
 
344 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05500  cell division ATP-binding protein FtsE  46.43 
 
 
280 aa  189  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5347  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  43.96 
 
 
214 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1035  cell division ATP-binding protein FtsE  44.81 
 
 
333 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0244  cell division ATP-binding protein FtsE  46.6 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  41.78 
 
 
229 aa  188  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1407  cell division ATP-binding protein FtsE  44.28 
 
 
229 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0924913  normal  0.397087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  43.65 
 
 
228 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09050  cell division ATP-binding protein FtsE  44.28 
 
 
278 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  43.94 
 
 
229 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0941  putative ATPase for cell division  47.96 
 
 
391 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1860  cell division ATP-binding protein FtsE  45.83 
 
 
235 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000300417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5034  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  43.96 
 
 
228 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4864  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  43.96 
 
 
228 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5416  cell division ABC transporter ATP-binding protein FtsE  43.96 
 
 
214 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5272  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  43.96 
 
 
214 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.995726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5290  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  43.48 
 
 
228 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2907  cell division ATP-binding protein FtsE  43.33 
 
 
235 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0405  cell division ATP-binding protein FtsE  45.83 
 
 
228 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0035586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4879  cell division ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
228 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5302  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  43.48 
 
 
228 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3966  cell division ATP-binding protein FtsE  42.59 
 
 
231 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000448693  unclonable  0.00000000011916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5654  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  43.48 
 
 
214 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  42.42 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  42.08 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  44.34 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1866  cell division ATP-binding protein FtsE  42.86 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0534138  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2769  cell division ATP-binding protein FtsE  43.66 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  42.42 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  41.28 
 
 
226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1480  cell division ATP-binding protein FtsE  45.33 
 
 
251 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.56344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1268  cell division ATP-binding protein FtsE  44.16 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.60111  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  41.4 
 
 
285 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1072  cell division ATP-binding protein FtsE  46.94 
 
 
487 aa  180  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1731  cell division ATP-binding protein FtsE  44.9 
 
 
229 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1244  cell division ATP-binding protein FtsE  45.18 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  42.57 
 
 
237 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  43.52 
 
 
227 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  43.56 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1932  cell division ATP-binding protein FtsE  45.81 
 
 
223 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  40 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>