24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3609 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  297  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  47.54 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  45.9 
 
 
128 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  31.01 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  28 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  28 
 
 
167 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
138 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  30.71 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
141 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  32.04 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 
128 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.86 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  26.32 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.42 
 
 
148 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.5 
 
 
136 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>