More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3128 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1231 aa  2560    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  58.54 
 
 
980 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.28 
 
 
586 aa  196  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.63 
 
 
544 aa  193  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
591 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
620 aa  190  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.34 
 
 
716 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  28.74 
 
 
888 aa  174  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  32.22 
 
 
741 aa  167  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.21 
 
 
570 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.18 
 
 
617 aa  167  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.55 
 
 
718 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.16 
 
 
712 aa  164  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  28.08 
 
 
788 aa  152  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  28.08 
 
 
788 aa  152  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  24.24 
 
 
880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
579 aa  149  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
1129 aa  149  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
1140 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  28.34 
 
 
737 aa  145  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.57 
 
 
773 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
1140 aa  145  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.54 
 
 
822 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
773 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  34.86 
 
 
749 aa  142  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.14 
 
 
831 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.85 
 
 
834 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
1140 aa  142  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.03 
 
 
702 aa  141  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  31.69 
 
 
788 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  30.13 
 
 
845 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.13 
 
 
811 aa  139  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  27.89 
 
 
707 aa  138  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  27.48 
 
 
872 aa  138  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.97 
 
 
501 aa  137  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  28.64 
 
 
665 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.48 
 
 
930 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  34.39 
 
 
514 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  25.96 
 
 
683 aa  136  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.92 
 
 
672 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.98 
 
 
846 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.5 
 
 
672 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  30 
 
 
729 aa  135  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.69 
 
 
696 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  32.5 
 
 
672 aa  135  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.08 
 
 
778 aa  135  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  26.81 
 
 
845 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  26.81 
 
 
845 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  30.5 
 
 
872 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.81 
 
 
845 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.81 
 
 
845 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31 
 
 
794 aa  133  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
845 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  28.81 
 
 
845 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  32.62 
 
 
661 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.55 
 
 
664 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  28.01 
 
 
564 aa  132  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  26.17 
 
 
867 aa  132  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  30.14 
 
 
872 aa  132  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.14 
 
 
872 aa  132  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  30.14 
 
 
872 aa  132  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  30.14 
 
 
872 aa  132  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  30.14 
 
 
872 aa  132  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  30.14 
 
 
872 aa  132  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.25 
 
 
810 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
848 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
848 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
846 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  27.72 
 
 
846 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.72 
 
 
848 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  27.1 
 
 
909 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  30.14 
 
 
872 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  29.06 
 
 
726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  32.62 
 
 
666 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  28.43 
 
 
874 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.77 
 
 
804 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  30.84 
 
 
659 aa  129  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  25.51 
 
 
899 aa  129  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
547 aa  129  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  28.12 
 
 
874 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  28.52 
 
 
848 aa  128  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  28.12 
 
 
874 aa  128  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  28.12 
 
 
874 aa  128  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  28.12 
 
 
874 aa  128  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 
503 aa  127  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.25 
 
 
664 aa  127  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.3 
 
 
730 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  31.69 
 
 
699 aa  127  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  29.47 
 
 
740 aa  126  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
658 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  28.9 
 
 
652 aa  126  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.49 
 
 
652 aa  126  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  29.08 
 
 
869 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.99 
 
 
768 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.29 
 
 
851 aa  125  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  25.12 
 
 
899 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  28.72 
 
 
869 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  30.28 
 
 
658 aa  124  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  30.13 
 
 
1455 aa  124  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4186  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
537 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>