More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2542 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2542  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
447 aa  928    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
713 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0982  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
702 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.02 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1655  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0659373  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2051  serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0809691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
865 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 
718 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  30.99 
 
 
666 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  32.16 
 
 
664 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  32.16 
 
 
664 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
625 aa  77  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2348  serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  26.83 
 
 
641 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
524 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 
646 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  26.83 
 
 
614 aa  73.9  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1717  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3308  Serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
601 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254724  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
519 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
519 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  26.83 
 
 
623 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  26.72 
 
 
634 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25.25 
 
 
563 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25.25 
 
 
563 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.95 
 
 
627 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  28.31 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27.97 
 
 
651 aa  70.9  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.47 
 
 
668 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1036  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
625 aa  69.7  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
540 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  25 
 
 
537 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.52 
 
 
662 aa  69.7  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.66 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6426  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 
880 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.66 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0464  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
582 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
612 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
642 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0122  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0828115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.48 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.94 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 
641 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0125  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  27.49 
 
 
620 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4371  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 
634 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.690427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.91 
 
 
602 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
776 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 
608 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2424  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0501957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
877 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3828  serine/threonine protein kinase  31.93 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.14 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
624 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
624 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
624 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  30 
 
 
1774 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  30.14 
 
 
668 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30 
 
 
653 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.05 
 
 
636 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
512 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
673 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.44 
 
 
747 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 
757 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  26.11 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3036  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.11 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.95 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0942  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
576 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0120  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
654 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.38 
 
 
632 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
611 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
660 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.17 
 
 
625 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.57 
 
 
806 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.12 
 
 
528 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  24.58 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4682  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
791 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.65 
 
 
518 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3036  Serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 
360 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 
480 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  29.17 
 
 
625 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0491  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
1070 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.424967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  29.19 
 
 
626 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3125  protein kinase  30.56 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.23 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
723 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.53 
 
 
1023 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
895 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  27.94 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  23.64 
 
 
621 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.19 
 
 
661 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>