195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1521 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1521  glucosamine-6-phosphate deaminase  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00621711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4486  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  48.37 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698126  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3109  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  50 
 
 
254 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.25876  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6213  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  49.18 
 
 
255 aa  249  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1699  Glucosamine-6-phosphate deaminase  48.97 
 
 
252 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297803  normal  0.026904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3353  glucosamine-6-phosphate deaminase  43.28 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2696  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  44.4 
 
 
259 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4629  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.62 
 
 
258 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2627  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.75 
 
 
269 aa  194  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0774  glucosamine-6-phosphate deaminase  39.82 
 
 
249 aa  188  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2098  glucosamine-6-phosphate deaminase  38 
 
 
255 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5244  glucosamine-6-phosphate deaminase  36.18 
 
 
259 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.965081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3264  glucosamine-6-phosphate deaminase  38.43 
 
 
257 aa  184  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0086269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2142  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.2 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784311  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0591  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.14 
 
 
259 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.858991  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4443  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  37.65 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  40.25 
 
 
255 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1394  glucosamine-6-phosphate deaminase  35.39 
 
 
254 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.807703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4121  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.850292  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3964  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3795  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3810  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4185  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4273  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4074  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.03 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  33.61 
 
 
262 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3883  glucosamine-6-phosphate deaminase  34.45 
 
 
262 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116143  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.8 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.98 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  35.11 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.76 
 
 
247 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.49 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.16 
 
 
236 aa  119  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.13 
 
 
242 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.55 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.71 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.12 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.55 
 
 
251 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.33 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0215  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.66 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.49 
 
 
249 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.89 
 
 
233 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.26 
 
 
234 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.87 
 
 
256 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1731  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.11 
 
 
245 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.598204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.87 
 
 
260 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.45 
 
 
256 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.75 
 
 
260 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.83 
 
 
268 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.95 
 
 
642 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.69 
 
 
260 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.83 
 
 
244 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.46 
 
 
260 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.43 
 
 
259 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.99 
 
 
252 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.84 
 
 
646 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.76 
 
 
637 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.82 
 
 
263 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.36 
 
 
236 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.67 
 
 
242 aa  100  3e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 
262 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.27 
 
 
641 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4131  hypothetical protein  27 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311207  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.21 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  29.25 
 
 
339 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.17 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.36 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.24 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.93 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.64 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2942  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.61 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.29 
 
 
266 aa  95.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0592  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  29.21 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0606  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  29.21 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  26.54 
 
 
670 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0128  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.61 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.39 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.69 
 
 
261 aa  92  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2029  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.1 
 
 
637 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.458898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.27 
 
 
266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.27 
 
 
266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.27 
 
 
266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.27 
 
 
266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.27 
 
 
266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.35 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.85 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3405  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  30.34 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.58 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  25.1 
 
 
657 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.2 
 
 
642 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.25 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.4 
 
 
303 aa  90.5  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.65 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.31 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.75 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  29.75 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  25.59 
 
 
642 aa  89  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05361  6-phosphogluconolactonase/glucosamine-6- phosphate isomerase/deaminase  27.93 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>