189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0437 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0437  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19320  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.15 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424338 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04330  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.34 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  27.94 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  22.9 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  27.61 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  23.13 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  27.34 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  21.05 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  27.68 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  25.98 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2524  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0543  ferric uptake regulator, Fur family  28 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.70942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  26.92 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  22.79 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25080  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  26.92 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  26.09 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  26.19 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0586  ferric uptake regulator, Fur family protein  32.54 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0940  ferric uptake regulator, Fur family  25.93 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  25.19 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  25.19 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  20.8 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  26.09 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  23.02 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  26.77 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  21.8 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  22.31 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  21.8 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  27.07 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  21.8 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  23.77 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  24 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  24 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  25.19 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  23.2 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  25.93 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  26.61 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1803  ferric uptake regulator family protein  25.83 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  26.47 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  19.55 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  22.4 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  23.81 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  24 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  26.52 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  26.09 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  22.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0461  ferric uptake regulator, Fur family  27.05 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  26.98 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  23.02 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  25.93 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  22.4 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  21.6 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  25.9 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0536  ferric uptake regulator family protein  26.23 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  25.4 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  25.6 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  23.73 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  23.02 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  24.81 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  20.79 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43000  Ferric-uptake regulator, fur  23.39 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  23.02 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  24 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  22.41 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  21.6 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  26.4 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  24.24 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  26.32 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  26.4 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  25.35 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  26.15 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  22.95 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  19.26 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  22.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>