More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0205 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0205  superoxide dismutase  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0562939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1628  Superoxide dismutase  47.09 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3725  superoxide dismutase  46.8 
 
 		 201 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  hitchhiker  0.00168961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  46.8 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2152  Superoxide dismutase  45.63 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0622589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  44.34 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  46.8 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1251  Mn/Fe superoxide dismutase  42.47 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.275789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1446  Mn/Fe superoxide dismutase  42.47 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.769471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  45.93 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  45.63 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2494  Superoxide dismutase  43.84 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  46.19 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  43.75 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45.45 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0749  superoxide dismutase  43.28 
 
 		 240 aa  175  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  45.1 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  42.16 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  43.07 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  44.06 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1235  Superoxide dismutase  42.86 
 
 		 198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4533  superoxide dismutase  39.44 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.0274714 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  42.51 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2050  Superoxide dismutase  40.87 
 
 		 262 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  44.19 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2024  Superoxide dismutase  40.87 
 
 		 262 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3962  superoxide dismutase  45.75 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  42.57 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00022  superoxide dismutase  43.93 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00410451  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0072  Superoxide dismutase  42.51 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  42.57 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  42.08 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  44.33 
 
 		 192 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  43.75 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5239  superoxide dismutase  44.34 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5300  superoxide dismutase, Mn  44.34 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5127  superoxide dismutase, manganese  44.34 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5142  superoxide dismutase, manganese  44.34 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0516387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  44.33 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5571  superoxide dismutase, Mn  43.87 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5696  superoxide dismutase, Mn  44.34 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5541  superoxide dismutase, Mn  44.34 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5378  superoxide dismutase, Mn  43.87 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000859451  normal  0.033463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2970  superoxide dismutase  41.71 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0056  Superoxide dismutase  42.03 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5579  superoxide dismutase, Mn  43.87 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  42.03 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  41.18 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5627  superoxide dismutase, Mn  43.87 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  44.66 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  43.27 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  43.27 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4160  superoxide dismutase  40.58 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  41.87 
 
 		 193 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  42.31 
 
 		 203 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4063  superoxide dismutase  41.06 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  42.72 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0458  superoxide dismutase  43.54 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  41.87 
 
 		 193 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  41.87 
 
 		 193 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03794  superoxide dismutase, Mn  42.03 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4387  superoxide dismutase  42.03 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4442  superoxide dismutase  39.61 
 
 		 208 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03743  hypothetical protein  42.03 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4440  superoxide dismutase  42.03 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5362  superoxide dismutase  42.03 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376376  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4076  Superoxide dismutase  41.55 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  45.81 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  41.43 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4109  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4138  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  43.35 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4301  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4453  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3773  superoxide dismutase  39.13 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4341  superoxide dismutase  41.55 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000961224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  42.29 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  41.43 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  41.38 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  45.97 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0035  superoxide dismutase  39.13 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  42.29 
 
 		 192 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4121  superoxide dismutase  39.13 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>