175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0063 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  49.36 
 
 		 243 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  45.06 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  38.98 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  39.08 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  39.32 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  40.17 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  37.12 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  36.86 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  31.76 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  33.62 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  35.19 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  32.48 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  32.9 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  32.47 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  32.47 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  32.47 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  32.47 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  29.61 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  34.51 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  32.03 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  32.03 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  32.47 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  31.49 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  33.19 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  31.6 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  31.6 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  31.6 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  31.6 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  31.6 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  30.6 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  31.49 
 
 		 246 aa  128  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  30.47 
 
 		 249 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  30.13 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  30.77 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  30.3 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  30.74 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  30.74 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  30.74 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  30.57 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  29.44 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  29.44 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  31.06 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  29.69 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  31.91 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  32.03 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  30.7 
 
 		 247 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  32.03 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  31.91 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  30.21 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  29.26 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  29.69 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  30.13 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  29.87 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  29.87 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  29.41 
 
 		 576 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  28.78 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  27.95 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 577 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  22.48 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  27.45 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 586 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.96 
 
 		 578 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  26.72 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  25.74 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  30.52 
 
 		 583 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  26.29 
 
 		 573 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  27.05 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  24.02 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  26.67 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  28.51 
 
 		 570 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  28.51 
 
 		 570 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 574 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  26.23 
 
 		 573 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  26.64 
 
 		 572 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  28.02 
 
 		 570 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  23.73 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  25.31 
 
 		 588 aa  70.1  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  25.82 
 
 		 572 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  25.82 
 
 		 572 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  25.82 
 
 		 572 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  25.82 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  25.82 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  25.82 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  29.09 
 
 		 580 aa  69.3  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  25.74 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  23.26 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  25 
 
 		 642 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  25.21 
 
 		 650 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  30.99 
 
 		 650 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  28.23 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 572 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  25.41 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  25.41 
 
 		 572 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>