37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0662 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0662  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0604  hypothetical protein  58.14 
 
 		 263 aa  334  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00834327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3085  hypothetical protein  46.47 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05140  N-formylglutamate amidohydrolase  43.68 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2900  hypothetical protein  35.02 
 
 		 663 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0409869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3220  hypothetical protein  33.61 
 
 		 664 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0915  hypothetical protein  34.58 
 
 		 664 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.699671  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4168  hypothetical protein  33.64 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11003  hypothetical protein  31.22 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0721852  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0218  hypothetical protein  30.25 
 
 		 663 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 672 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0176  hypothetical protein  25.42 
 
 		 656 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3899  N-formylglutamate amidohydrolase  26.58 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1252  N-formylglutamate amidohydrolase  25 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4905  hypothetical protein  43.64 
 
 		 62 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38069  normal  0.738025 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1854  N-formylglutamate amidohydrolase  26.77 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1296  N-formylglutamate amidohydrolase  25.56 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569801  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1602  N-formylglutamate amidohydrolase  27.13 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  0.819611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1652  N-formylglutamate amidohydrolase  24.42 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1839  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1104  N-formylglutamate amidohydrolase  23.77 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0126  N-formylglutamate amidohydrolase  22.86 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2183  N-formylglutamate amidohydrolase  22.89 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2082  N-formylglutamate amidohydrolase  22.86 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2205  N-formylglutamate amidohydrolase  22.86 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0067  N-formylglutamate amidohydrolase  23.01 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.365229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1399  hypothetical protein  23.01 
 
 		 286 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1037  N-formylglutamate amidohydrolase  23.39 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00781993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0386  N-formylglutamate amidohydrolase  22.49 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.823231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2547  N-formylglutamate amidohydrolase  23.59 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5219  N-formylglutamate amidohydrolase  25.6 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4631  N-formylglutamate amidohydrolase  26.57 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.946227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2716  N-formylglutamate amidohydrolase  25.5 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2656  N-formylglutamate amidohydrolase  36.59 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3996  N-formylglutamate amidohydrolase  23.21 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5476  N-formylglutamate deformylase  22.49 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2790  N-formylglutamate amidohydrolase  25.5 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0159  N-formylglutamate amidohydrolase  25.55 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>