More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0108 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  83.19 
 
 		 113 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  74.34 
 
 		 113 aa  176  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  73.45 
 
 		 113 aa  174  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  74.34 
 
 		 113 aa  174  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1998  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  70.8 
 
 		 113 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0090  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  70.8 
 
 		 113 aa  167  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.12 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 116 aa  104  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.12 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  47.37 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  48.25 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.12 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.3 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.22 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0013  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  42.98 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  46.49 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  46.36 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  46.49 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.74 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>