More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1998 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1998  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 113 aa  223  9e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  91.15 
 
 		 113 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  88.5 
 
 		 113 aa  205  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  88.5 
 
 		 113 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0090  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  84.07 
 
 		 113 aa  191  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  72.57 
 
 		 113 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  70.8 
 
 		 113 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  54.39 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50.88 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  54.39 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 136 aa  105  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.88 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  53.51 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  51.75 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  50.86 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  50 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  50 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  51.75 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.85 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>