33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0497 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  100 
 
 		 342 aa  711    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  60.71 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  56.47 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  32.06 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  32.06 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  29.94 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.56 
 
 		 503 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  30.96 
 
 		 503 aa  116  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  26.77 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  29.94 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  28.16 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  28.16 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  32.8 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.46 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  29.3 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  26.92 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  28.49 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  27.01 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  27.49 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  30.16 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  25.36 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  25.91 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  26.61 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  29.45 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  25.98 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  25.24 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  27.41 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  24.06 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  25.4 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  24.62 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  24.59 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  23.31 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  28.01 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>