16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0847 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
410 aa  810    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  49.21 
 
 
284 aa  245  8e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0464  solute binding protein-like protein  33.57 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 
274 aa  89.7  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
328 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
258 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2755  glycoside hydrolase family 12  31.47 
 
 
332 aa  87  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00186286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  27.9 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  26.72 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0848  hypothetical protein  28.75 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.420421  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0340  glycoside hydrolase family 12  25.16 
 
 
322 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1988  hypothetical protein  27 
 
 
351 aa  63.5  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  28.22 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3987  glycoside hydrolase family 12  30.77 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  29.27 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>